La creación de grupos regionales de investigación se inscribe en la perspectiva de la FLACSO de contribuir en nuevas prácticas de las ciencias sociales. Aunque cada unidad FLACSO funciona de manera descentralizada, se exige un trabajo de investigación comparada, un intercambio de docentes y estudiantes y una cooperación al desarrollo de las regiones. Según Ayrton Fausto, hay que valorar los esfuerzos de la FLACSO que van en el sentido de esta integración. En este momento, existen 16 grupos FLACSO de investigación comparada.

El grupo regional de investigación sobre gobierno y desarrollo local esta empezando. Se tratara de estudiar y analizar las políticas publicas, los mecanismos de control existentes. Tambien se reunira a distintos actores para reflexionar sobre el proceso democrático local. Todavía el grupo no tiene una agenda de trabajo.